Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis18aQ9CZJ6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms