Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snf8Q9CZ28 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms