Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kdm8Q9CXT6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm8Q9CXT6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms