Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed5Q9CXE7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms