Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9CWU4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CWU4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CWU4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms