Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU2

Zdhhc13, Palmitoyltransferase ZDHHC13, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc13Q9CWU2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zdhhc13Q9CWU2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zdhhc13Q9CWU2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms