Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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