Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms