Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms