Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ergic3Q9CQE7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms