Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab5aQ9CQD1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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