Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms