Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp3Q9CQ10 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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