Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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