Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlhe41Q99PV5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe41Q99PV5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms