Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem2Q99NH8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms