Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PccbQ99MN9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PccbQ99MN9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms