Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gdpd3Q99LY2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gdpd3Q99LY2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gdpd3Q99LY2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gdpd3Q99LY2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdpd3Q99LY2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gdpd3Q99LY2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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