Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp16Q99LG0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Usp16Q99LG0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms