Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nmd3Q99L48 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms