Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q99KU6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q99KU6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q99KU6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q99KU6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q99KU6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q99KU6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms