Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ciao1Q99KN2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms