Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms