Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf11Q99JX1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms