Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ddb2Q99J79 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ddb2Q99J79 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ddb2Q99J79 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ddb2Q99J79 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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