Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms