Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb6Q922F4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms