Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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