Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms