Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcdhga12Q91XY7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcdhga12Q91XY7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms