Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csde1Q91W50 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csde1Q91W50 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms