Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubg2Q8VCK3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubg2Q8VCK3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms