Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp4Q8R2N2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp4Q8R2N2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms