Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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