Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc3Q8K3W3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casc3Q8K3W3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms