Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fbxo18Q8K2I9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fbxo18Q8K2I9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms