Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcf3Q8K268 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms