Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1eQ8K202 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms