Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c1Q8K193 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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