Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Afg3l2Q8JZQ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Afg3l2Q8JZQ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms