Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd4lQ8CFI0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4lQ8CFI0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms