Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms