Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms