Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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