Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh13Q8CEE7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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