Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc17Q8CE13 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms