Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe22Q8C6A8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms