Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc113Q8C5T8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Ccdc113Q8C5T8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Ccdc113Q8C5T8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc113Q8C5T8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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