Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx16Q8C080 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Snx16Q8C080 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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