Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD5

She, SH2 domain-containing adapter protein E, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SheQ8BSD5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SheQ8BSD5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SheQ8BSD5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms